有关土地证与拆迁补偿

我买了一套98年的2手房（泉州市区），当时这套房子可以以经济适用房的价格购买，但房主为了日后交易方便，以商品房的价格购买的，可以算商品房，土地证也齐全，但中介说，这套房子介于商品房与经济适用房之间，土地证转让的具体款项还没有出来，产权证目前不能过户，是这样吗？土地证要是不能过户，对房屋以后拆迁赔偿会有影响吗？